Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NCF4Q15080 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms