| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.333-201 | ENST00000365274 | 102 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-658P-201 | ENST00000384606 | 106 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP354-201 | ENST00000391247 | 136 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.623-201 | ENST00000411128 | 95 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-607P-201 | ENST00000411283 | 108 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL117337.1-201 | ENST00000412789 | 444 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC083867.1-201 | ENST00000413567 | 457 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL32P35-201 | ENST00000415214 | 394 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL139396.1-201 | ENST00000421137 | 167 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NUP35P1-201 | ENST00000422734 | 947 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC098614.2-201 | ENST00000426040 | 255 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL627311.1-201 | ENST00000431514 | 115 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL355340.1-201 | ENST00000433085 | 344 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL078601.1-201 | ENST00000444542 | 271 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | UBBP3-201 | ENST00000445497 | 241 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | snoU13.28-201 | ENST00000459235 | 104 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC128713.1-201 | ENST00000471495 | 306 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SL283P-201 | ENST00000489055 | 303 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008948.1-201 | ENST00000506058 | 325 nt | TSL 2 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC097473.1-201 | ENST00000508142 | 408 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BMPR1B-AS1-201 | ENST00000510795 | 511 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC026782.1-201 | ENST00000512952 | 449 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-103P-201 | ENST00000516502 | 125 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC087854.1-201 | ENST00000519706 | 414 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC040936.1-201 | ENST00000534543 | 172 nt | TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NACAP3-201 | ENST00000552100 | 481 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC126177.2-201 | ENST00000552154 | 452 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL591516.1-201 | ENST00000611326 | 274 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC083806.3-201 | ENST00000614016 | 455 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DAOA-AS1_2.1-201 | ENST00000614829 | 187 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR6128-201 | ENST00000615528 | 109 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DLEU2_5.1-201 | ENST00000615567 | 84 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC084757.4-201 | ENST00000616350 | 526 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HOTTIP_4.1-201 | ENST00000618195 | 165 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC007792.1-201 | ENST00000623023 | 402 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC018692.1-202 | ENST00000623559 | 676 nt | TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR4C16-201 | ENST00000623907 | 933 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FAM184A-202 | ENST00000352896 | 3700 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BCLAF1-205 | ENST00000527536 | 5371 nt | TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FPGT-TNNI3K-202 | ENST00000370895 | 7566 nt | TSL 2 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SLC9C1-205 | ENST00000487372 | 3979 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DDX6-206 | ENST00000534980 | 4538 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.47-201 | ENST00000362697 | 108 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-266P-201 | ENST00000364225 | 107 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA75B-201 | ENST00000384053 | 137 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.645-201 | ENST00000391229 | 102 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL26P27-201 | ENST00000414397 | 437 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ELF3-AS1-201 | ENST00000415582 | 500 nt | TSL 2 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL513477.1-202 | ENST00000417061 | 214 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | U51244.1-201 | ENST00000423120 | 374 nt | TSL 3 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL731563.1-201 | ENST00000442202 | 214 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS12P18-201 | ENST00000442381 | 270 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NDUFB1P2-201 | ENST00000449477 | 176 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GSTA11P-201 | ENST00000452866 | 669 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL583843.1-201 | ENST00000456070 | 346 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092919.1-201 | ENST00000467896 | 229 nt | TSL 2 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.661-201 | ENST00000516003 | 99 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-976P-201 | ENST00000516086 | 111 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-764P-201 | ENST00000516396 | 105 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1332P-201 | ENST00000516666 | 104 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC023866.1-201 | ENST00000518064 | 579 nt | TSL 4 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009902.1-201 | ENST00000519351 | 183 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LRRC37A5P-203 | ENST00000580181 | 585 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR3668-201 | ENST00000582138 | 75 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC002044.1-201 | ENST00000606707 | 158 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009229.3-201 | ENST00000608056 | 282 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC069200.1-201 | ENST00000609511 | 323 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HIKESHI-208 | ENST00000618164 | 499 nt | TSL 5 BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL162373.1-201 | ENST00000620433 | 407 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ABCG2-204 | ENST00000515655 | 4276 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LUZP4-201 | ENST00000371920 | 1701 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CREBRF-201 | ENST00000296953 | 7778 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-562P-201 | ENST00000362731 | 107 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.153-201 | ENST00000363615 | 91 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1059P-201 | ENST00000363752 | 98 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORD56.5-201 | ENST00000364281 | 72 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1303P-201 | ENST00000364841 | 107 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.324-201 | ENST00000365165 | 102 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-214P-201 | ENST00000384130 | 107 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-306P-201 | ENST00000384617 | 107 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA40C-201 | ENST00000391285 | 128 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP003170.3-201 | ENST00000399123 | 158 nt | TSL 5 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.594-201 | ENST00000410373 | 140 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP120-201 | ENST00000410900 | 112 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP492-201 | ENST00000411330 | 114 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC099548.1-201 | ENST00000421443 | 426 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL365496.1-201 | ENST00000426885 | 215 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CBX3P6-201 | ENST00000430257 | 527 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTATP6P7-201 | ENST00000453315 | 681 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL26P9-201 | ENST00000457466 | 433 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC099499.1-201 | ENST00000505040 | 558 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC074250.1-201 | ENST00000511117 | 192 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1016P-201 | ENST00000516689 | 94 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC026241.1-201 | ENST00000517873 | 2142 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HSPE1P20-201 | ENST00000538133 | 289 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PSMA4-205 | ENST00000558281 | 773 nt | TSL 3 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BNIP3P16-201 | ENST00000589779 | 534 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC104695.3-201 | ENST00000604052 | 296 nt | BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL359962.2-201 | ENST00000610044 | 303 nt | TSL 5 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SLC30A6-202 | ENST00000357055 | 4758 nt | TSL 2 BASIC | 3.12 | □□□□□ -1.91 | | |