Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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SCN5AQ14524 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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