Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SCARF1Q14162 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SCARF1Q14162 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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