Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CACNA1CQ13936 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
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