Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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