Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CUL1Q13616 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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