Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATRQ13535 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATRQ13535 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ATRQ13535 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ATRQ13535 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
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