Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PRPF4BQ13523 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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