Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQSTM1Q13501 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms