Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSLNQ13421 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms