Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATMQ13315 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATMQ13315 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATMQ13315 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATMQ13315 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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