Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SEMA3FQ13275 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172 ms