Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms