Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
IFT88Q13099 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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