Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CENPEQ02224 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms