Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
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CENPFP49454 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CENPFP49454 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CENPFP49454 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
CENPFP49454 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CENPFP49454 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CENPFP49454 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CENPFP49454 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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CENPFP49454 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
CENPFP49454 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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CENPFP49454 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CENPFP49454 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
CENPFP49454 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CENPFP49454 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CENPFP49454 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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CENPFP49454 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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CENPFP49454 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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CENPFP49454 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPFP49454 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPFP49454 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPFP49454 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPFP49454 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPFP49454 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPFP49454 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CENPFP49454 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPFP49454 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CENPFP49454 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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