Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPRCP08575 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms