Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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