Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
BRPF3Q9ULD4 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRPF3Q9ULD4 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRPF3Q9ULD4 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRPF3Q9ULD4 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRPF3Q9ULD4 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
BRPF3Q9ULD4 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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