Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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COPS7AQ9UBW8 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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COPS7AQ9UBW8 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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COPS7AQ9UBW8 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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COPS7AQ9UBW8 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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COPS7AQ9UBW8 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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COPS7AQ9UBW8 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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COPS7AQ9UBW8 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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COPS7AQ9UBW8 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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