Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RTN1Q16799 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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RTN1Q16799 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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RTN1Q16799 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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