Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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SCN9AQ15858 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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SCN9AQ15858 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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SCN9AQ15858 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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SCN9AQ15858 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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SCN9AQ15858 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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SCN9AQ15858 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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SCN9AQ15858 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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