Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CHRNA6Q15825 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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