Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGN3Q15651 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGN3Q15651 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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