Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NECTIN1Q15223 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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