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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AP005136.1-201 | ENST00000579765 | 429 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | LINC00907-210 | ENST00000593316 | 847 nt | TSL 3 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL031274.2-201 | ENST00000599419 | 203 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC119751.7-201 | ENST00000600494 | 245 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNU6-6P-201 | ENST00000606623 | 107 nt | BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL160408.5-201 | ENST00000607759 | 526 nt | TSL 4 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | SNX10-209 | ENST00000619420 | 2361 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | OR8K3-204 | ENST00000641689 | 2380 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.91 | □□□□□ -2.1 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNU6-1120P-201 | ENST00000362988 | 108 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNA5SP137-201 | ENST00000516833 | 135 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MDM2-221 | ENST00000517852 | 393 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC145141.2-201 | ENST00000518473 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC010620.1-201 | ENST00000601088 | 1102 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC136475.10-201 | ENST00000620253 | 385 nt | BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | CD44-239 | ENST00000639002 | 528 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ZBTB6-201 | ENST00000373659 | 4106 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.9 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MTND4P1-201 | ENST00000457501 | 1466 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RMDN2-203 | ENST00000402091 | 1973 nt | TSL 2 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | U3.13-201 | ENST00000364804 | 214 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNA5SP138-201 | ENST00000365098 | 114 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | Y_RNA.553-201 | ENST00000384670 | 102 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MIR544A-201 | ENST00000384855 | 91 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | TRDJ2-201 | ENST00000390475 | 54 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNU2-29P-201 | ENST00000410423 | 189 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | HMGB3P2-201 | ENST00000411913 | 584 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC009158.1-206 | ENST00000417476 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MORF4L1P6-201 | ENST00000418771 | 268 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MTCO2P34-201 | ENST00000421994 | 607 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL355674.1-201 | ENST00000423681 | 648 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC007285.2-201 | ENST00000433088 | 518 nt | TSL 3 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | INTS6-AS1-201 | ENST00000434512 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MTCO1P19-201 | ENST00000443487 | 500 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC055731.1-201 | ENST00000474387 | 401 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC010424.1-201 | ENST00000506336 | 297 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC010493.1-201 | ENST00000513479 | 292 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC105417.1-201 | ENST00000514691 | 285 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNU2-69P-201 | ENST00000516061 | 100 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNA5SP281-201 | ENST00000516504 | 135 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNU6-667P-201 | ENST00000517186 | 102 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC108449.1-202 | ENST00000517632 | 478 nt | TSL 3 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AP003392.2-201 | ENST00000527269 | 208 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AP000763.2-201 | ENST00000540641 | 163 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC023050.3-201 | ENST00000541142 | 333 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | NDUFA5P6-201 | ENST00000542110 | 379 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL139193.1-201 | ENST00000554967 | 539 nt | TSL 4 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC005909.1-201 | ENST00000577835 | 755 nt | TSL 3 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MIR5694-201 | ENST00000581190 | 76 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MIR5007-201 | ENST00000583098 | 95 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC091135.1-201 | ENST00000585943 | 307 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC008752.3-201 | ENST00000588113 | 712 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | Z82243.1-201 | ENST00000609432 | 473 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | DLEU2_1.1-201 | ENST00000612089 | 120 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | DLEU2_1.2-201 | ENST00000614667 | 120 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL159153.1-201 | ENST00000619688 | 317 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | SLITRK6-201 | ENST00000400286 | 4318 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |