Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SMC1AQ14683 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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