Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CCINQ13939 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCINQ13939 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCINQ13939 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms