Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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PKP1Q13835 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKP1Q13835 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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