Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RUNX3Q13761 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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