Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MSLNQ13421 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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