Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
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SKP2Q13309 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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SKP2Q13309 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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SKP2Q13309 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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SKP2Q13309 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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SKP2Q13309 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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SKP2Q13309 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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SKP2Q13309 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SKP2Q13309 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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