Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ERCC8Q13216 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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ERCC8Q13216 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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ERCC8Q13216 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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ERCC8Q13216 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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ERCC8Q13216 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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ERCC8Q13216 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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