Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CALCOCO2Q13137 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CALCOCO2Q13137 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 336.1 ms