Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAF3Q13114 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms