Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms