Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXA13P31271 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms