Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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PKHD1P08F94 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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PKHD1P08F94 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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PKHD1P08F94 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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PKHD1P08F94 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PKHD1P08F94 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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