Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CEP290O15078 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CEP290O15078 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CEP290O15078 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CEP290O15078 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms