Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
J3KRW8 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
J3KRW8 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
J3KRW8 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
J3KRW8 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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