Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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SH3BP4Q9P0V3 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SH3BP4Q9P0V3 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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