Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3CQ99985 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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