Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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MEIS3Q99687 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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MEIS3Q99687 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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MEIS3Q99687 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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MEIS3Q99687 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MEIS3Q99687 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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