Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ZBED3Q96IU2 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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