Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLIP4Q8N3C7 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLIP4Q8N3C7 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms