Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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USP41Q3LFD5 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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USP41Q3LFD5 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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USP41Q3LFD5 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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USP41Q3LFD5 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
USP41Q3LFD5 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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USP41Q3LFD5 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
USP41Q3LFD5 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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