Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CTU2Q2VPK5 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms