Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
FAM187BQ17R55 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM187BQ17R55 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms