Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SIX1Q15475 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SIX1Q15475 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SIX1Q15475 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SIX1Q15475 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SIX1Q15475 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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SIX1Q15475 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SIX1Q15475 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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SIX1Q15475 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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SIX1Q15475 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SIX1Q15475 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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